چکیده 1
فصل اول: مقدمه و اهداف
1-1- مقدمه 3
1-2- دیدگاه نوین در برنامه های اصلاح نژادی اسب 4
1-3- اهداف پژوهش 4
فصل دوم: بررسی منابع
2-1- اسب های ایران 6
2-1-1- تاریخچه و خصوصیات اسب نژاد ترکمن 6
2-1-1-1- ویژگی های خاص اسب های ترکمن 8
2-1-1-2- خصوصیات ظاهری اسب ترکمن 8
2-1-1-3- پراکندگی اسب ترکمن 10
2-1-1-4- تیره های اسب ترکمن 10
2-1-2- تاریخچه و خصوصیات اسب نژاد عرب 10
2-1-2-1- مشخصات ظاهری اسب عرب 12
2-1-3- تاریخچه و خصوصیات اسب نژاد اسبچه خزر 14
2-1-3-1- خصوصیات ظاهری 15
2-1-3-2- کاربری 17
2-1-3-3- پراکندگی 17
2-1-4- تاریخچه و خصوصیات اسب نژاد تروبرد 18
2-1-4-1- منشاء اسب های تروبرد 18
2-1-4-2- معرفی نژاد تروبرد 19
2-1-4-3- صفات ظاهری 19
2-1-4-4- نقاط ضعف اسب تروبرد 21
2-1-4-5- کاربری 21
2-2- نقش بیوتکنولوژی در اصلاح نژاد اسب 21
2-3- استفاده از نشانگرهای مولکولی در برنامه های انتخاب اسب 22
2-3-1- اهمیت نشانگرهای مولکولی در اصلاح نژاد اسب 22
2-4- نشانگرهای ژنتیکی 23
2-5- واکنش زنجیره ای پلیمراز 23
2-6- RFLP بر مبنای PCR 24
2-6-1- مزایای RFLP 25
2-6-2- معایب RFLP 25
2-7- ژنوم اسب 25
2-8- رنگ های پایه 26
2-9- رقت ها 27
2-9-1- ژن های رقت رنگ 29
2-9-2- رقت کرم رنگ 30
2-9-3- قهوه ای کمرنگ (سمند) 30
2-9-4- شامپاینی 31
2-9-5- نقره ای (خالخالی) 31
2-10- خالدارسازی رنگ سفید و الگوهای رنگدانه زدایی 32
2-10-1- رنگ خاکستری 32
2-10-2- رنگ بلوطی 35
2-10-3- کهر، سیاه (آگوتی) 35
2-10-4- رنگ سفید 36
2-11- ژن MATP 36
2-11-1- بررسی چند شکلی های شناسایی شده ژن MATP 37
فصل سوم: مواد و روش ها
3-1- تهیه نمونه های تحقیق 40
3-2- مشخصات صفت ثبت شده 40
3-3- استخراج DNA 41
3-3-1- جزئیات و مراحل جداسازی DNA 41
3-3-1-1- لیز کردن سلول 41
3-3-1-2- Binding DNA 42
3-3-1-3- شستشو 42
3-3-1-4- DNA ELUTION 42
3-4- تعیین کیفیت DNA 43
3-5- روش اکتروفورز روی ژل آگاروز 43
3-6- جایگاه مورد مطالعه 43
3-7- اجزای واکنش PCR 44
3-8- مراحل انجام واکنش PCR 44
3-9- بهینه سازی واکنش PCR 45
3-9-1- محاسبه ی دمای اتصال پرایمر 45
3-9-2- تعیین غلظت MgCl 46
3-9-3- سیکل حرارتی PCR 46
3-10- الکروفورز محصول PCR 46
3-11- هضم آنزیمی محصولات PCR 47
3-12- الکتروفورز محصولات حاصل از هضم آنزیمی I509 Tsp 48
فصل چهارم: نتیجه گیری و بحث
4-1- کیفیت DNA استخراجی 50
4-2- واکنش زنجیره ای پلیمراز PCR 50
4-3- هضم با آنزیم برشی I 509 Tsp و واکنش PCR-RFLP 51